علم میکروبیولوژی به مطالعه ساختار و عملکرد میکروارگانیسم ها و روش های مطالعاتی برای استفاده و کنترل فعالیت میکروارگانیسم ها تقسیم می شود.
میکروب شناسی به باکتری شناسی، ویروس شناسی، قارچ شناسی، انگل شناسی و غیره تقسیم می گردد. میکروبیولوژی دارویی شاخه ای کاربردی از علم میکروبیولوژی است. میکروبیولوژی دارویی شامل مطالعه میکروارگانیسم‌های خاص مرتبط با ساخت داروها و به حداقل رساندن یا حذف تعداد میکروارگانیسم‌ها در محیط تولید است.
به عنوان مثال می توان به حداقل رساندن تعداد میکروارگانیسم‌ها در یک محیط تولیدی، شامل خود میکروارگانیسم‌ها و یا محصولات جانبی میکروبی آن ها مانند اگزوتوکسین و اندوتوکسین از آب و سایر مواد اولیه و اطمینان از استریل بودن محصولات دارویی نهایی اشاره کرد.
جنبه‌های دیگر میکروبیولوژی دارویی شامل تحقیق و توسعه عوامل ضد عفونی کننده، استفاده از میکروارگانیسم‌ها برای شناسایی فعالیت‌های جهش‌زا و سرطان‌زا در داروها و استفاده از میکروارگانیسم‌ها در ساخت محصولات دارویی مانند انسولین و هورمون رشد انسانی می باشد.
